Indonesia - Halmahera

Spalding et al. (2001) treat Halmahera as part of the Moluccas, the island groups west of Irian Jaya, which they place in a deep-water sub-region of complex bathymetry where even close neighbors can be separated by more than 1,000 m of water. They say little about Halmahera itself beyond its currents and outlying reefs. During the Northeast Monsoon, a current runs north through the passage between Irian Jaya and Halmahera, reversing in the Southeast Monsoon, and several small atolls lie offshore to the east of the island. Nationally, they estimate Indonesia's reef area at about 51,020 km², around 18% of the world total, with 443 coral species recorded and a higher estimate of 581-602 for the wider biogeographic region. Souter et al. (2021) group the Halmahera ecoregion with the Papua, Banda Sea, Northeast Sulawesi, Gulf of Papua, and Arafura Sea ecoregions in one East Asian Seas subregion of 20,568 km², 26% of the region's reef. The region as a whole holds 78,272 km² of reef and nearly 600 reef-building coral species.

In that subregion, Souter et al. (2021) found that modeled hard coral cover fluctuated considerably over the record while algal cover stayed roughly constant, but the estimate rests on 503 sites, only six of them monitored for more than 15 years. Across the East Asian Seas, the 2010 and 2016 bleaching events cut coral cover, and of 55 long-monitored sampling units that lost at least a fifth of their coral, 25 had not regained 90% of their earlier cover by the 2020 assessment. Earlier, Wilkinson (2006) had described Southeast Asian reefs as still declining in 2004, with some recovery in Indonesia, and judged that only 10-20% of the region's more than 630 marine protected areas were effectively managed.

The Halmahera sites were dived on an August 2026 liveaboard crossing and fall into three groups. The northern group, in the Ternate-Tidore strait, includes Maitara North, Failonga, AM Point 2, and night dives off the Ternate waterfront. A southern group holds current-swept points and drifts such as Pulau Sebatang, Kusu Drift, Tower Corner, Proco, and Jerot. A western group is made up of offshore seamounts and boulder fields, among them Batu Mandi, Batu Balong, Siko Pinnacle, and Reene's Rock. Most day dives share one profile. Sand, rubble, or sponge-crusted walls sit at 25-35 m, the mid-slope carries shingled foliose plates (Montipora, Echinopora, Pachyseris-type), and the shallow crest is near-continuous staghorn and tabulate Acropora.

The shallows hold the best coral. Anderson ranked Pulau Sebatang among the best coral dives he has done, Tower Corner peaked at 2-7 m, and at Proco no frame came close to bare substrate. Other sites are defined by different communities. Maitara North has a shingled tower of plate coral, while Batu Mangga and Reene's Rock are dominated by sponges, ascidians, and soft corals. Batu Mandi's summit is blanketed in arborescent soft coral. Hard coral cover (Claude CV) across 23 daytime sites ranged from 11.6% at Siko Pinnacle to 56.5% in the Batu Balong shallows near the anchorage. Jerot also logged 22-25°C and thermoclines, several degrees colder than the rest of the crossing.

Most dives recorded no bleaching, disease, or crown-of-thorns. Old, coralline-bound mortality is common: standing dead staghorn at Failonga and Siko Tanjung, and rubble aprons at Tanjung Naraka and AM Point 2. Recent stress is patchy. Crown-of-thorns were photographed at Merida Cavern, beside fresh feeding scars, and at Mugia. Lelay Utara showed active partial bleaching on part of its shallow plateau. Single white or pale colonies turned up at Kusu Drift, Kusu Ridge, Tanjung Dehebra, and Batu Mandi, and Siko Tanjung had a handful of chalk-white massives.

Notable sightings include walking sharks (Hemiscyllium) at Pantai Falajawa, ornate ghost pipefish at Cimitero, and the largest devil ray school Anderson has seen, logged at Tanjung Naraka.

Spalding et al. (2001) memperlakukan Halmahera sebagai bagian dari Maluku (Moluccas), gugus-gugus pulau di sebelah barat Irian Jaya, yang mereka tempatkan dalam subkawasan perairan dalam dengan batimetri kompleks, tempat pulau-pulau yang berdekatan pun dapat dipisahkan oleh perairan sedalam lebih dari 1,000 m. Mereka hanya sedikit membahas Halmahera sendiri selain arus dan terumbu-terumbu terluarnya. Selama Muson Timur Laut, arus mengalir ke utara melalui selat antara Irian Jaya dan Halmahera, lalu berbalik arah pada Muson Tenggara, dan beberapa atol kecil terletak di lepas pantai sebelah timur pulau tersebut. Secara nasional, mereka memperkirakan luas terumbu Indonesia sekitar 51,020 km², sekitar 18% dari total dunia, dengan 443 spesies karang tercatat dan perkiraan yang lebih tinggi, 581-602 spesies, untuk kawasan biogeografis yang lebih luas. Souter et al. (2021) mengelompokkan ekoregion Halmahera bersama ekoregion Papua, Laut Banda (Banda Sea), Sulawesi Timur Laut (Northeast Sulawesi), Teluk Papua (Gulf of Papua), dan Laut Arafura (Arafura Sea) dalam satu subkawasan Laut Asia Timur (East Asian Seas) seluas 20,568 km², atau 26% dari terumbu kawasan tersebut. Kawasan ini secara keseluruhan memiliki 78,272 km² terumbu dan hampir 600 spesies karang pembentuk terumbu.

Di subkawasan tersebut, Souter et al. (2021) mendapati bahwa tutupan karang keras hasil pemodelan berfluktuasi cukup besar sepanjang periode data, sementara tutupan alga relatif tetap, tetapi perkiraan ini bertumpu pada 503 lokasi, dan hanya enam di antaranya yang dipantau selama lebih dari 15 tahun. Di seluruh Laut Asia Timur, peristiwa pemutihan tahun 2010 dan 2016 menurunkan tutupan karang, dan dari 55 unit pengambilan sampel yang dipantau jangka panjang dan kehilangan sedikitnya seperlima karangnya, 25 unit belum kembali mencapai 90% dari tutupan sebelumnya pada saat penilaian tahun 2020. Sebelumnya, Wilkinson (2006) menggambarkan terumbu Asia Tenggara masih terus menurun pada tahun 2004, dengan sedikit pemulihan di Indonesia, dan menilai bahwa hanya 10-20% dari lebih dari 630 kawasan konservasi perairan di kawasan tersebut yang dikelola secara efektif.

Lokasi-lokasi Halmahera diselami dalam pelayaran kapal liveaboard pada Agustus 2026 dan terbagi menjadi tiga kelompok. Kelompok utara, di selat Ternate-Tidore, meliputi Maitara North, Failonga, AM Point 2, dan penyelaman malam di lepas tepi laut kota Ternate. Kelompok selatan berisi tanjung dan jalur hanyut (drift) yang tersapu arus, seperti Pulau Sebatang, Kusu Drift, Tower Corner, Proco, dan Jerot. Kelompok barat terdiri atas gunung laut (seamount) lepas pantai dan hamparan bongkahan batu, di antaranya Batu Mandi, Batu Balong, Siko Pinnacle, dan Reene's Rock. Sebagian besar penyelaman siang memiliki profil yang sama. Pasir, pecahan karang, atau dinding berkerak spons berada pada kedalaman 25-35 m, lereng tengah ditumbuhi karang lembaran foliosa yang bersusun seperti sirap (tipe Montipora, Echinopora, Pachyseris), dan puncak terumbu yang dangkal berupa Acropora tanduk rusa dan berbentuk meja yang nyaris tak terputus.

Perairan dangkal menyimpan karang terbaik. Anderson menempatkan Pulau Sebatang di antara penyelaman karang terbaik yang pernah ia lakukan, Tower Corner mencapai puncaknya pada kedalaman 2-7 m, dan di Proco tidak ada satu bingkai foto pun yang mendekati substrat gundul. Lokasi lain dicirikan oleh komunitas yang berbeda. Maitara North memiliki menara karang lembaran yang bersusun seperti sirap, sedangkan Batu Mangga dan Reene's Rock didominasi spons, ascidian, dan karang lunak. Puncak Batu Mandi diselimuti karang lunak berbentuk pohon. Indeks tutupan berbasis foto untuk penyelaman terumbu siang hari berkisar dari 22.9% di Reene's Rock, yang merupakan komunitas bongkahan batu dan bukan terumbu sejati, hingga 41.4% di Jerot. Jerot juga mencatat suhu 22-25°C dan termoklin, beberapa derajat lebih dingin daripada bagian lain pelayaran.

Sebagian besar penyelaman tidak mencatat pemutihan, penyakit, atau bintang laut mahkota duri. Kematian lama yang sudah terikat alga koralin umum dijumpai: tanduk rusa mati yang masih berdiri di Failonga dan Siko Tanjung, serta hamparan pecahan karang di Tanjung Naraka dan AM Point 2. Tekanan baru hanya terjadi setempat-setempat. Bintang laut mahkota duri difoto di Merida Cavern, di samping bekas makan yang masih baru, dan di Mugia. Lelay Utara menunjukkan pemutihan sebagian yang aktif pada sebagian dataran dangkalnya. Koloni tunggal yang putih atau pucat dijumpai di Kusu Drift, Kusu Ridge, Tanjung Dehebra, dan Batu Mandi, dan di Siko Tanjung terdapat beberapa koloni masif yang putih seperti kapur.

Penampakan yang patut dicatat meliputi hiu berjalan (Hemiscyllium) di Pantai Falajawa, ikan pipa hantu hias (ornate ghost pipefish) di Cimitero, dan kawanan pari setan (devil ray) terbesar yang pernah dilihat Anderson, tercatat di Tanjung Naraka.