Indonesia - Raja Ampat

Spalding et al. (2001) never name Raja Ampat. The nearest landmark in their Indonesia chapter is the Bird's Head (Doberai) Peninsula, which falls in the last of the sub-regions in their account, the Moluccas and Irian Jaya. They characterize that sub-region as bathymetrically complex, with clear oceanic water so deep that islands only tens of kilometers apart can lie on either side of channels more than 1,000 m deep. One of its only two true continental-shelf areas is a shallow platform west of the Bird's Head, yet the authors had little or no information on the reef communities around the peninsula, and they describe Indonesia as holding a huge range of reefs, many poorly known or not described at all. For the country as a whole, they estimate about 51,020 km² of coral reef, roughly 18% of the global total and more than any other nation, and list 443 recorded coral species against an estimate of 581-602 for its wider biogeographic region. Souter et al. (2021) include Indonesia in the East Asian Seas region, which overlaps the Coral Triangle and holds 78,272 km² of reef (just over 30% of the world's total) and nearly 600 reef-building coral species.

Wilkinson (2006), summarizing the 2004 Southeast Asia assessment, reported that reef condition across the region had kept declining, though Indonesia showed some signs of coral recovery; the main direct pressures were overfishing and destructive fishing, land-based pollution, and sediment from coastal development and deforestation. For the East Asian Seas as a whole, Souter et al. (2021) estimate that hard coral cover climbed from 32.9% in 1999 to 40.8% in 2009, fell to 35% by 2012 after the 2010 mass bleaching, dipped to 33.9% in 2017 after the 2016 event, and stood near 36.8% in 2019. They caution that even the earliest records probably describe reefs already altered by people, and that monitoring has favored accessible, well-known sites, while many reefs in the large archipelagic nations remain hard for researchers to reach.

This unit gathers 24 pins from a liveaboard trip dived between 16 and 23 October 2018. Most lie in two parts of Raja Ampat: the Dampier Strait and Fam/Penemu group in the north (Cape Kri, Blue Magic, Mioskon, My Reef, Melissa's Garden) and the Misool area in the south (Shadow Reef, Barracuda Rock, Four Kings, Nudi Rock, Little Juliet, Anchovy, Two Tree Island). It also carries three dives at Pulau Koon, which the pins place off eastern Seram in the Banda Sea, and Karang Paradise, whose region is not established. Settings range from pinnacles and seamounts (Blue Magic, Four Kings, My Reef) to sheer walls below undercut limestone islets (Nudi Rock, Two Tree Island), a very sheltered fringing reef at Barracuda Rock, and a sand muck site beside a Dampier Strait town pier. Logged maximum depths ran from 15.4 m at Nudi Rock to 35.3 m at Cape Kri.

Soft corals are prominent almost everywhere: Sinularia and Sarcophyton recur on most dives, soft-coral cover exceeded hard at Shadow Reef and Little Juliet, and deeper walls carry sea fans, black coral, and green Tubastraea. Hard coral concentrates on reef tops and shallows. Melissa's Garden logged Acropora tables 5 m across and branching acroporids at 100% cover through most of the shallows; Barracuda Rock logged at least 60-70 hard coral species. Seriatopora hystrix and S. caliendrum are common at many sites, and plating Pachyseris and Montipora dominate at depth. Hard coral cover (Claude CV) across 12 sites ran from 7.2% at Two Tree Island to 44.4% at Karang Paradise, with Melissa's Garden at 40.9%; Anderson's in-water impressions were sometimes higher, more than 40-50% in places at Nudi Rock.

Most dives logged no bleaching, but photographs from Mioskon and Blue Magic show a minority of chalk-white colonies beside pigmented neighbors, and a Pulau Koon close-up series shows stark-white Acropora branches; all are flagged rather than diagnosed. Some Seriatopora hystrix looked white or sickly at My Reef and The Lagoon. Fish biomass was very high, with giant trevally, tuna, barracuda, batfish, Napoleon wrasse, and gray reef sharks at several sites, three wobbegongs at My Reef, epaulette sharks on the Misool night dive, a hammerhead at Karang Paradise, and pygmy seahorses at Anchovy and Little Juliet. Strong current shaped the dives at My Reef and Two Tree Island.

Spalding et al. (2001) tidak pernah menyebut Raja Ampat. Penanda terdekat dalam bab Indonesia mereka adalah Semenanjung Kepala Burung (Bird's Head Peninsula, Doberai), yang termasuk subkawasan terakhir dalam uraian mereka, yaitu Maluku (Moluccas) dan Irian Jaya. Mereka mencirikan subkawasan tersebut sebagai kawasan dengan batimetri yang kompleks, dengan perairan oseanik jernih yang begitu dalam sehingga pulau-pulau yang hanya berjarak puluhan kilometer dapat terletak di kedua sisi kanal yang dalamnya lebih dari 1,000 m. Salah satu dari hanya dua kawasan paparan benua sejati di subkawasan ini adalah dataran dangkal di sebelah barat Kepala Burung, namun para penulis hanya memiliki sedikit atau sama sekali tidak memiliki informasi tentang komunitas terumbu di sekitar semenanjung tersebut, dan mereka menggambarkan Indonesia sebagai negara dengan ragam terumbu yang sangat besar, banyak di antaranya kurang dikenal atau sama sekali belum dideskripsikan. Untuk negara ini secara keseluruhan, mereka memperkirakan luas terumbu karang sekitar 51,020 km², kira-kira 18% dari total global dan lebih besar daripada negara lain mana pun, serta mencantumkan 443 spesies karang yang tercatat dibandingkan dengan perkiraan 581-602 spesies untuk kawasan biogeografisnya yang lebih luas. Souter et al. (2021) memasukkan Indonesia ke dalam kawasan Laut Asia Timur (East Asian Seas), yang tumpang tindih dengan Segitiga Terumbu Karang (Coral Triangle) dan memiliki 78,272 km² terumbu (sedikit di atas 30% dari total dunia) serta hampir 600 spesies karang pembentuk terumbu.

Wilkinson (2006), dalam ringkasan penilaian Asia Tenggara tahun 2004, melaporkan bahwa kondisi terumbu di seluruh kawasan terus menurun, meskipun Indonesia menunjukkan beberapa tanda pemulihan karang; tekanan langsung utamanya adalah penangkapan ikan berlebih dan penangkapan ikan yang merusak, pencemaran dari daratan, serta sedimen dari pembangunan pesisir dan penggundulan hutan. Untuk Laut Asia Timur secara keseluruhan, Souter et al. (2021) memperkirakan bahwa tutupan karang keras naik dari 32.9% pada tahun 1999 menjadi 40.8% pada tahun 2009, turun menjadi 35% pada tahun 2012 setelah pemutihan massal tahun 2010, menurun ke 33.9% pada tahun 2017 setelah peristiwa tahun 2016, dan berada di sekitar 36.8% pada tahun 2019. Mereka mengingatkan bahwa catatan paling awal pun kemungkinan menggambarkan terumbu yang sudah diubah oleh manusia, dan bahwa pemantauan cenderung berfokus pada lokasi yang mudah diakses dan terkenal, sementara banyak terumbu di negara-negara kepulauan besar masih sulit dijangkau para peneliti.

Unit ini menghimpun 24 titik (pin) dari pelayaran kapal liveaboard pada Oktober 2018. Sebagian besar terletak di dua bagian Raja Ampat: kelompok Selat Dampier (Dampier Strait) dan Fam/Penemu di utara (Cape Kri, Blue Magic, Mioskon, My Reef, Melissa's Garden) serta kawasan Misool di selatan (Shadow Reef, Barracuda Rock, Four Kings, Nudi Rock, Little Juliet, Anchovy, Two Tree Island). Unit ini juga mencakup tiga penyelaman di Pulau Koon, yang oleh titik-titik tersebut ditempatkan di lepas Seram bagian timur di Laut Banda (Banda Sea), dan Karang Paradise, yang kawasannya belum dapat dipastikan. Lokasinya beragam, mulai dari puncak karang (pinnacle) dan gunung laut (Blue Magic, Four Kings, My Reef) hingga dinding tegak di bawah pulau-pulau kecil batu kapur yang dasarnya tergerus (Nudi Rock, Two Tree Island), terumbu tepi yang sangat terlindung di Barracuda Rock, dan lokasi muck berpasir di samping dermaga sebuah kota di Selat Dampier.

Karang lunak menonjol hampir di mana-mana: Sinularia dan Sarcophyton muncul berulang kali di sebagian besar penyelaman, tutupan karang lunak melebihi karang keras di Shadow Reef dan Little Juliet, dan dinding yang lebih dalam ditumbuhi kipas laut, karang hitam, dan Tubastrea hijau. Karang keras terkonsentrasi di puncak terumbu dan perairan dangkal. Di Melissa's Garden tercatat meja Acropora selebar 5 m dan akroporid bercabang dengan tutupan 100% di sebagian besar perairan dangkalnya; di Barracuda Rock tercatat sedikitnya 60-70 spesies karang keras. Seriatopora hystrix dan S. caliendrum umum dijumpai di banyak lokasi, dan Pachyseris serta Montipora berbentuk lembaran mendominasi di kedalaman. Tutupan berbasis foto di sembilan lokasi Raja Ampat yang difoto berkisar dari 18.6% di Shadow Reef hingga 40.7% di Melissa's Garden; kesan Anderson di dalam air sering kali lebih tinggi, di beberapa tempat di Nudi Rock lebih dari 40-50%.

Sebagian besar penyelaman tidak mencatat pemutihan, tetapi foto-foto dari Mioskon dan Blue Magic memperlihatkan sebagian kecil koloni yang putih seperti kapur di samping tetangganya yang berpigmen, dan serangkaian foto jarak dekat di Pulau Koon memperlihatkan cabang-cabang Acropora yang putih bersih; semuanya ditandai, bukan didiagnosis. Beberapa Seriatopora hystrix tampak putih atau tidak sehat di My Reef dan The Lagoon. Biomassa ikan sangat tinggi, dengan ikan kuwe raksasa (giant trevally), tuna, barakuda, ikan kelelawar (batfish), ikan Napoleon, dan hiu karang abu-abu di beberapa lokasi, tiga hiu wobbegong di My Reef, hiu epaulette pada penyelaman malam di Misool, seekor hiu martil di Karang Paradise, dan kuda laut kerdil di Anchovy dan Little Juliet. Arus yang kuat mewarnai penyelaman di My Reef dan Two Tree Island.